Chegando à Ilha Milos para procurarem pelas Ervas da Cura, nossos heróis, juntamente com um morador da ilha, Lewis, encontraram Tornadus e Thundurus, os Pokémon Lendários. As cunhas erguidas para mantê-los afastados foram destruídas (pela Equipe Rocket), e agora eles estão batalhando ferozmente, ameaçando a existência da ilha.